疑點
某企業(yè)為增值稅一般納稅人，主營專用設備制造業(yè)，產(chǎn)品對外主要出口到美國、印度和俄羅斯等20多個國家，在國內(nèi)主要銷往各大油田，在某沿海城市設有一個全資子公司，生產(chǎn)的產(chǎn)品與總公司相同，也出口海外。
2013年6月，稅務機關的納稅評估系統(tǒng)顯示，某企業(yè)存在涉稅疑點指標：
——2011年、2012年沒有增值稅入庫，稅負率明顯偏低；
——2011年、2012年增值稅應稅銷售收入與主營業(yè)務收入之比，2011年為94.7%、2012年為83.32%；
——企業(yè)銷售毛利率由2011年的37.5%降到29.2%，降幅為8.3%。

約談
根據(jù)疑點數(shù)據(jù)，評估人員對該公司的情況進行了案頭分析，并做了書面約談。

對連續(xù)兩年沒有增值稅入庫的問題，企業(yè)回復稱，這兩年企業(yè)的進項稅額比較高，2011年進項稅額為4526萬元，其中，機器設備進項稅為255萬元，運費進項稅為35萬元，原材料及輔助材料、低值品、外購產(chǎn)成品進項稅為4232萬元；2012年進項稅額為8159萬元，其中，機器設備進項稅為300萬元，運費進項稅為37萬元，原材料及輔助材料、低值品、外購產(chǎn)成品進項稅為7822萬元。

對于2011年、2012年增值稅應稅銷售收入與主營業(yè)務收入之比連續(xù)下降，企業(yè)解釋說，自2011年開始，公司開始有直接出口業(yè)務，因出口業(yè)務按會計準則確認主營業(yè)務收入，而增值稅銷售收入是按稅法要求確認，即查到單證信息方可錄入，所以增值稅銷售收入與財務上的主營業(yè)務收入確認有時間性差異。隨著國外訂單的增長，出口業(yè)務增多，外銷收入增加從而導致兩者差異增加。2011年會計準則確認出口收入15757萬元，增值稅應稅出口收入13300萬元，差異2457萬元，影響占比5.3%。2012年會計準則確認出口收入25608萬元，增值稅應稅出口收入22387萬元，差異3221萬元，影響占比6.2%。

另外，根據(jù)《國家稅務總局關于增值稅納稅義務發(fā)生時間有關問題的公告》（國家稅務總局2011年40號公告），該公司有5427萬元的發(fā)出商品按會計準則確認收入，按公告規(guī)定此部分收入不在增值稅收入中，影響占比10.48%。

企業(yè)銷售毛利率降幅達8.3%，則是因為2012年公司的全資子公司——某沿海子公司開始投入生產(chǎn)，為打造統(tǒng)一品牌，實現(xiàn)規(guī)?；睾Ｗ庸旧a(chǎn)的產(chǎn)品全部通過該公司對外銷售，關聯(lián)交易價格為直接銷售第三方價格。因此，公司從關聯(lián)方采購的產(chǎn)品零毛利，直接影響了公司的毛利率。2012年與沿海子公司關聯(lián)交易金額為12192萬元，這就造成在利潤沒有增加的情況下，主營業(yè)務成本卻增加了12192萬元。如扣除此因素影響，銷售毛利為38.2%，與上年基本持平。根據(jù)《特別納稅調(diào)整辦法（試行）》第三十條，實際稅負相同的境內(nèi)關聯(lián)方之間的交易，只要該交易沒有直接或間接導致國家總體稅收收入的減少，原則上不做轉讓定價調(diào)查、調(diào)整。